Santoso menjabat sebagai Kepala Suku Dinas Pendidikan Wilayah I Jakarta Selatan yang membawahi Kecamatan Kebayoran Lama, Jagakarsa, Pesanggrahan, dan Cilandak. Beliau bertanggung jawab mengoordinasikan pembinaan serta pengawasan satuan pendidikan agar berjalan efektif, transparan, dan berorientasi pada peningkatan mutu layanan.
Dalam kepemimpinannya, Santoso mendorong kolaborasi antar sekolah dan pemangku kepentingan guna menciptakan ekosistem pendidikan yang adaptif, inovatif, dan berfokus pada kualitas pembelajaran bagi peserta didik di wilayah tersebut.